Znaleziska 
ceramiki poświadczają istnienie otwartej osady na terenie obecnego 
Smęgorzyna już we wczesnym średniowieczu. Nie oznacza to jednak, że 
ludzie nie mieszkali tu o wiele wcześniej. Pierwsza wzmianka na temat 
wsi pochodzi z 1394 roku (Smangorsin). Używane były również nazwy Smengorschin, Smogorzyno, Smangrzin.
 W XVI wieku znany jest niejaki Piotr Pekunt ze Smęgorzyna, wymieniany 
na gdańskich tablicach woskowych. W 1570 Smęgorzyno było wsią szlachecką
 w posiadaniu Grzegorza Smengorzyńskiego i Krzysztofa Borkowskiego. W 
późniejszych czasach właścicielami wsi byli często panowie pobliskiego 
Kiełpina Górnego, którzy czerpali ze wsi dochody. W XVIII wieku przy 
trakcie do Kartuz istniała należąca do Smęgorzyna karczma o nazwie Poggen Krug
 (Żabia Karczma). Została zapewne zniszczona w czasie wojen 
napoleońskich. W tych czasach Smęgorzyno należało do Michała 
Pastoriusza, starosty w Stolzenbergu pod Gdańskiem (obecnie Chełm). W 
1885 roku było tu 10 domów i 109 mieszkańców (97 katolików i 12 
ewangelików). Dużą częścią dochodów mieszkańców była hodowla inwentarza 
żywego. Pod koniec XIX wieku wybudowano stojący do dnia dzisiejszego 
dworek. Po pierwszej wojnie światowej Smęgorzyno znalazło się w Polsce. 
Właścicielami majątku byli wówczas gospodarze o nazwisku Bach. W czasie 
drugiej wojny światowej we wsi stacjonowała bateria obrony 
przeciwlotniczej. Po zakończeniu wojny majątek został rozparcelowany. 
Miejscowość włączono w granice administracyjne miasta w 1973 roku. 
Obecnie okolica jest intensywnie zabudowywana domami jednorodzinnymi.                       
 
